Trị giá tính thuế theo điều kiện giao hàng FOB

DN bên mình nhập khẩu hàng hóa theo điều kiện giao hàng FOB. theo mình được biết thì điều kiện này thì Hải quan sẽ cộng cước vận tải vào giá FOB. Nếu như vậy thì Trị giá tính thuế của hàng hóa đã có cước vận tải biển có đúng không? Nhưng mà mình lại tính cước biển đó vào chi phí ở phần nhập khẩu để tăng giá vốn hàng hoá. Như vậy là mình đã nhập 2 lần à? Bạn nào biết về vấn đề này thì giúp mình hạch toán cho đúng với.